三、代開票納稅人
達到自開票納稅人條件的，可以按自開票納稅人資格認定規(guī)定申請辦理自開票納稅人認定手續(xù)。
發(fā)票管理
貨物運輸業(yè)必須使用全國統(tǒng)一的發(fā)票，發(fā)票的樣式和內容由國家稅務總局另行制定。鐵路運輸、航空運輸、海洋運輸?shù)呢浳镞\輸業(yè)發(fā)票應按照國家稅務總局統(tǒng)一規(guī)定的格式、內容印制和使用。自開票納稅人向主管地方稅務局申請領購并自行開具貨物運輸業(yè)發(fā)票，自開票納稅人應按照發(fā)票管理辦法及相關的法律、法規(guī)的規(guī)定，如實填開貨物運輸業(yè)發(fā)票，加蓋財務印章和開票人專章。自開票納稅人必須按照規(guī)定逐欄、如實填開貨物運輸業(yè)發(fā)票。凡開具給增值稅一般納稅人的貨物運輸業(yè)發(fā)票，必須填寫該增值稅一般納稅人的名稱和納稅人識別號。自開票納稅人對下列情況不得開具貨物運輸業(yè)發(fā)票：（一）未提供貨物運輸勞務；（二）非貨物運輸勞務；（三）由其他納稅人（包括承包人、承租人及掛靠人）提供的貨物運輸勞務。 在全國實行新的由稅控器具開具貨物運輸業(yè)發(fā)票以前，自開票納稅人在申報繳納營業(yè)稅時，除報送營業(yè)稅申報表外，必須向主管地方稅務局報送《自開票納稅人貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》的紙制文件和電子信息。納稅人自行雕刻開票人專章。
納稅申報
對自開票納稅人實行查賬征收方法。對自開票納稅人開具的貨物運輸業(yè)發(fā)票注明的運費和其他價外收費，一律按“交通運輸業(yè)”稅目征收營業(yè)稅。
對自開票納稅人的聯(lián)運業(yè)務，以其向貨主收取的運費及其他價外收費減去付給其他聯(lián)運合作方運費后的余額為營業(yè)額計算征收營業(yè)稅。 以上所稱聯(lián)運必須同時符合以下條件：（一）自開票納稅人必須參與該項貨物運輸業(yè)務；（二）聯(lián)運合作方向自開票納稅人開具貨物運輸業(yè)發(fā)票；（三）自開票納稅人必須將其接受的貨物運輸業(yè)發(fā)票作為原始計賬憑證，妥善保管，以備稅務機關檢查。
自開票納稅人在申報繳納營業(yè)稅時，除報送營業(yè)稅申報表外，必須向主管地方稅務局報送《自開票納稅人貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》的紙制文件和電子信息�！蹲蚤_票納稅人貨物運輸發(fā)票清單》、《增值稅運輸發(fā)票抵扣清單》的電子信息采集軟件，由國家稅務總局統(tǒng)一開發(fā)，并免費提供使用。納稅人可從國家稅務總局網站自行下載使用。
提供貨物運輸勞務的單位向其機構所在地主管地方稅務局申報繳納營業(yè)稅。
資格審驗和確認
地方稅務局應按年度對自開票、代開票納稅人進行資格審驗和確認。年審的時間從每年11月起至12月底結束，具體期限由省級地方稅務局確定。
自開票納稅人年審的內容
1.基本情況。包括納稅人名稱、經營地址、經濟性質、經營范圍、開戶銀行及賬號、車輛、船舶等運輸工具狀況、聯(lián)系電話等。
2.納稅情況。包括本年度實現(xiàn)的營業(yè)額、營業(yè)成本、應納稅額、實繳稅額和欠繳稅額等。
3.財務核算情況。包括會計人員配備、賬簿設置、財務核算狀況等。
4.貨物運輸發(fā)票管理情況。包括貨物運輸業(yè)發(fā)票領購、使用、結存、保管、繳銷及違章情況。
年審的程序
�。ㄒ唬┌凑漳陮徱�(guī)定的時間要求，自開票納稅人應到主管地方稅務局領取《自開票、代開票納稅人年審申請審核表》（以下簡稱《年審表》），填寫蓋章后連同工商營業(yè)執(zhí)照副本、道路、水上運輸經營許可證復印件、稅務登記證副本、《發(fā)票領購簿》、年度財務報表及稅務機關要求提供的其他資料，一并報主管地方稅務局。
�。ǘ┲鞴艿囟惥纸拥阶蚤_票納稅人申報的《年審表》及有關資料后30日內進行初審，并簽署初審意見，逐級報送上級審批機關，審批機關應在30日內作出年審結論。年審審批機關是指有批準認定自開票、代開票納稅人資格的縣級或縣級以上的地方稅務局。
年審的結果
�。ㄒ唬� 自開票納稅人1.年審合格的處理對年審合格的自開票納稅人，在《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅自開票納稅人認定證書》及《發(fā)票領購簿》上加貼自開票納稅人年審合格標識。
�。ǘ┠陮彶缓细竦奶幚磉_不到自開票納稅人資格的納稅人，暫緩通過年審，在3個月內進行整改，整改期間不得自行開具貨物運輸業(yè)發(fā)票，如需開具貨物運輸業(yè)發(fā)票的由主管地方稅務局代開。在規(guī)定的期限內，整改合格的按年審合格辦法處理，整改不合格的取消其自開票納稅人資格，清繳貨物運輸發(fā)票，并在其稅務登記證副本首頁右上方和《發(fā)票領購簿》上加蓋“已取消自開票納稅人資格”專用章，并收回《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅自開票納稅人認定證書》。 納稅人必須在規(guī)定的期限內向地方稅務局辦理年審手續(xù)，在規(guī)定期限內未辦理年審手續(xù)的按年審不合格處理。
對已具有自開票納稅人資格的提供貨物運輸勞務單位，一旦發(fā)現(xiàn)有下列情形之一的，經主管地方稅務局審定，可取消其自開票納稅人的資格，收回《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅自開票納稅人認定證書》和停止其使用貨物運輸業(yè)發(fā)票。
�。ㄒ唬� 沒有按地方稅務局的要求正確核算貨物運輸和非貨物運輸?shù)臓I業(yè)收入、營業(yè)成本、稅金、營業(yè)利潤的；
（二） 不能按規(guī)定向稅務機關進行正常納稅申報和繳納各項稅款的；
�。ㄈ� 有偷稅、抗稅行為的；
（四） 不能妥善保管、使用貨物運輸業(yè)發(fā)票造成嚴重后果的；
�。ㄎ澹� 違反規(guī)定，對貨物運輸和非貨物運輸業(yè)務都開具貨物運輸業(yè)發(fā)票的；
�。� 違反規(guī)定，為其他納稅人開具貨物運輸業(yè)發(fā)票的。
凡被取消自開票、代開票納稅人資格的納稅人，一年內不得再重新申請認定自開票、代開票納稅人。
《年審表》填報不實、數(shù)據(jù)不準確的，隨同《年審表》報送其他資料不齊全，以及其他未按規(guī)定辦理年審手續(xù)的，地方稅務局應責令其在年審規(guī)定期內如實申報和補報。如仍不如實申報和補報的，則按年審不合格處理。
新認定的當年不年審。
對營業(yè)稅減稅免稅的管理辦法
符合營業(yè)稅法規(guī)規(guī)定的減免條件的自開票納稅人，應向主管地方稅務局報送有關資料，并經主管地方稅務局認定后才能享受減免營業(yè)稅優(yōu)惠。