1.企業(yè)向職工發(fā)放的通訊補貼的個人所得稅問題。
根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于個人所得稅有關(guān)政策問題的通知》（國稅發(fā)〔1999〕58號）第二條規(guī)定，企業(yè)向職工發(fā)放的通訊補貼，扣除一定標(biāo)準(zhǔn)的公務(wù)費用后，按照“工資、薪金”所得項目計征個人所得稅。公務(wù)費用扣除標(biāo)準(zhǔn)由當(dāng)?shù)卣贫ǎ?u>如當(dāng)?shù)卣粗贫ü珓?wù)費用扣除標(biāo)準(zhǔn)，按通訊補貼全額的20%作為個人收入扣繳個人所得稅。
2.企業(yè)為職工繳付的補充醫(yī)療保險的個人所得稅問題。
根據(jù)《財政部國家稅務(wù)總局關(guān)于住房公積金醫(yī)療保險金、養(yǎng)老保險金征收個人所得稅問題的通知》（財稅字〔1997〕144號）規(guī)定，應(yīng)扣繳個人所得稅。如果企業(yè)委托保險公司單獨建賬，集中管理，未建立個人賬戶，應(yīng)按企業(yè)統(tǒng)一計提時所用的具體標(biāo)準(zhǔn)乘以每人每月工資總額計算個人每月應(yīng)得補充醫(yī)療保險，全額并入當(dāng)月工資扣繳個人所得稅。
3.企業(yè)為職工購買的人身意外險的個人所得稅問題。
根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于單位為員工支付有關(guān)保險繳納個人所得稅問題的批復(fù)》（國稅函〔2005〕318號）規(guī)定，企業(yè)為員工支付各項免稅之外的保險金，應(yīng)在企業(yè)向保險公司繳付時并入員工當(dāng)期的工資收入，按“工資、薪金所得”項目計征個人所得稅。
4.企業(yè)向職工發(fā)放交通補貼的個人所得稅問題。
根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于個人所得稅有關(guān)政策問題的通知》（國稅發(fā)〔1999〕58號）第二條規(guī)定，企業(yè)采用報銷私家車燃油費等方式向職工發(fā)放交通補貼的行為，扣除一定標(biāo)準(zhǔn)的公務(wù)費用后，按照“工資、薪金”所得項目計征個人所得稅。公務(wù)費用扣除標(biāo)準(zhǔn)由當(dāng)?shù)卣贫�，如�?dāng)?shù)卣粗贫ü珓?wù)費用扣除標(biāo)準(zhǔn)，按交通補貼全額的30%作為個人收入扣繳個人所得稅。
5.企業(yè)年金的個人所得稅問題。
根據(jù)《財政部國家稅務(wù)總局關(guān)于個人所得稅有關(guān)問題的批復(fù)》（財稅〔2005〕94號）規(guī)定，應(yīng)按企業(yè)統(tǒng)一計提年金時所用的具體標(biāo)準(zhǔn)乘以每人每月工資總額計算個人每月應(yīng)得年金，扣繳個人所得稅。
6.公司向解除勞動關(guān)系的人員支付一次性補償費的個人所得稅問題。
根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于行政機(jī)關(guān)應(yīng)扣未扣個人所得稅問題的批復(fù)》（國稅函〔2004〕1199號）規(guī)定，應(yīng)責(zé)成扣繳義務(wù)人向納稅人追繳稅款。
7.金融保險企業(yè)開展的以業(yè)務(wù)銷售附帶贈送個人實物的個人所得稅問題。
金融保險企業(yè)開展的以業(yè)務(wù)銷售附帶贈送個人實物的應(yīng)按規(guī)定扣繳個人所得稅。沒有贈送記錄明細(xì)，無法按人扣繳個人所得稅的，按合理比例統(tǒng)一扣繳個人所得稅。