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首先，確保股東投入的50萬元合規(guī)，如果是合規(guī)的，那么需要經過注冊資本重新計算的流程。 1、首先，股東需要寫出一份變更注冊資本的申請書，將50萬元從資本公積中退回給股東； 2、申請書中需要出具股東身份證明、委托書等相關資料； 3、向工商局提出申請，并向稅務機構報備變更后的注冊資本，等待工商局審核； 4、審核通過后，股東向資本公積提出收回50萬元的申請，并出具有效的發(fā)票資料； 5、將資本公積里50萬元轉移到股東的個人賬戶里； 6、三方（股東、公司、工商局）簽訂變更公司注冊資本相關文件； 7、修改公司章程，把50萬元收回給股東的部分消除； 以上就是股東把50萬退回給資本公積所需要操作的步驟，注意在操作中遵守國家相關法律法規(guī)，避免不合規(guī)操作。更進一步，股東可以在注冊資本重新計算前，尋求稅務、會計、律師和公司注冊代理機構的協(xié)助，以減少不必要的錯誤。 拓展知識： 在操作注冊資本重新計算的過程中，一定要注意付款的時機，因為根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅暫行條例》，如果是在變更前就付款的，那么該增資部分的收入稅將擔由股東個人負擔，而如果是在變更后付款的，則可以由本公司或者上級公司負擔。