企業(yè)進(jìn)口貨物，按照海關(guān)提供的完稅憑證上注明的增值稅額，借記“應(yīng)交稅費(fèi)——應(yīng)交增值稅（進(jìn)項(xiàng)稅額）”科目，按照進(jìn)口貨物應(yīng)計(jì)入采購成本的金額，借記“材料采購”、“商品采購”、“原材料”等科目，按照應(yīng)付或?qū)嶋H支付的金額，貸記“應(yīng)付賬款”、“銀行存款”等科目。其具體會計(jì)處理方法與國內(nèi)購進(jìn)貨物的處理方法相同，只是扣稅依據(jù)不同。
2.繳納增值稅的會計(jì)處理
企業(yè)上繳增值稅時(shí)，借記“應(yīng)交稅費(fèi)——應(yīng)交增值稅（已交稅金）”科目，貸記“銀行存款”科目。收到退回多繳的增值稅，作相反的會計(jì)分錄。
3.轉(zhuǎn)出多交增值稅和未交增值稅的會計(jì)處理
為了分別反映增值稅一般納稅企業(yè)欠交增值稅款和待抵扣增值稅的情況，避免出現(xiàn)企業(yè)在以前月份有欠交增值稅，以后月份有未抵扣增值稅時(shí)，用以前月份欠交增值稅抵扣以后月份未抵扣的增值稅的現(xiàn)象，確保企業(yè)及時(shí)足額上交增值稅，企業(yè)應(yīng)在“應(yīng)交稅費(fèi)”科目下設(shè)置“未交增值稅”明細(xì)科目，核算企業(yè)月份終了從“應(yīng)交稅費(fèi)——應(yīng)交增值稅”科目中轉(zhuǎn)入的當(dāng)月未交或多交的增值稅；同時(shí)，在“應(yīng)交稅費(fèi)——應(yīng)交增值稅”科目下設(shè)置“轉(zhuǎn)出未交增值稅”和“轉(zhuǎn)出多交增值稅”專欄。
月份終了，企業(yè)計(jì)算出當(dāng)月應(yīng)交未交的增值稅，借記“應(yīng)交稅費(fèi)一應(yīng)交增值稅（轉(zhuǎn)出未交增值稅）”科目，貸記“應(yīng)交稅費(fèi)——未交增值稅”科目；當(dāng)月多交的增值稅，借記“應(yīng)交稅費(fèi)——未交增值稅”科目，貸記“應(yīng)交稅費(fèi)——應(yīng)交增值稅（轉(zhuǎn)出多交增值稅）”科目，經(jīng)過結(jié)轉(zhuǎn)后，月份終了，“應(yīng)交稅費(fèi)——應(yīng)交增值稅”科目的余額，反映企業(yè)尚未抵扣的增值稅。“應(yīng)交稅費(fèi)——未交增值稅”科目的期末借方余額，反映多交的增值稅，貸方余額，反映未交的增值稅。
值得注意的是，企業(yè)當(dāng)月交納當(dāng)月的增值稅，仍然通過“應(yīng)交稅費(fèi)——應(yīng)交增值稅（已交稅金）”科目核算；當(dāng)月交納以前各期未交的增值稅，則通過“應(yīng)交稅費(fèi)——未交增值稅”科目核算，不通過“應(yīng)交稅費(fèi)——應(yīng)交增值稅（已交稅金）”科目核算。
4.減免及返還增值稅的會計(jì)處理
實(shí)行增值稅后，國家仍在一定范圍內(nèi)保留了減稅、免稅，并采取直接減免、即征即退、先征后退、先征稅后返還等形式。
對企業(yè)減免及返還的增值稅，除按照國家規(guī)定有指定用途的項(xiàng)目以外，都應(yīng)并入企業(yè)利潤，照章征收企業(yè)所得稅。
對直接減免和即征即退的，應(yīng)并入企業(yè)當(dāng)年利潤征收企業(yè)所得稅；對先征稅后返還和先征后退的，應(yīng)并入企業(yè)實(shí)際收到退稅或返還稅款年度的利潤征收企業(yè)所得稅。
在會計(jì)處理時(shí)，對于直接減免的增值稅，借記“應(yīng)交稅費(fèi)——應(yīng)交增值稅（減免稅款）”科目，貸記“營業(yè)外收入”科目。對于企業(yè)實(shí)際收到即征即退、先征后退、先征稅后返還的增值稅，借記“銀行存款”科目，貸記“營業(yè)外收入”科目。
5.小規(guī)模納稅人增值稅會計(jì)處理
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由于小規(guī)模納稅企業(yè)實(shí)行簡易辦法計(jì)算交納增值稅，其購入貨物或接受應(yīng)稅勞務(wù)所支付的增值稅額應(yīng)直接計(jì)入有關(guān)貨物及勞務(wù)的成本。在編制會計(jì)分錄時(shí)，應(yīng)按支付的全部價(jià)款和增值稅，借記“材料采購”、“原材料”、“制造費(fèi)用”、“管理費(fèi)用”、“經(jīng)營費(fèi)用”、“其他業(yè)務(wù)成本”等科目，貸記“銀行存款”、“應(yīng)付賬款”、“應(yīng)付票據(jù)”等科目。
（二）銷售貨物或提供應(yīng)稅勞務(wù)的會計(jì)處理
小規(guī)模納稅企業(yè)銷售貨物或提供應(yīng)稅勞務(wù)，應(yīng)按實(shí)現(xiàn)的銷售收入（不含稅）與按規(guī)定收取的增值稅額合計(jì)，借記“銀行存款”、“應(yīng)收賬款”、“應(yīng)收票據(jù)”等科目，按實(shí)現(xiàn)的不含稅銷售收入，貸記“主營業(yè)務(wù)收入”、“商品銷售收入”、“其他業(yè)務(wù)收入”等科目，按規(guī)定收取的增值稅額，貸記“應(yīng)交稅費(fèi)——應(yīng)交增值稅”科目。發(fā)生的銷貨退回，作相反的會計(jì)分錄。
（三）繳納增值稅款的會計(jì)處理
小規(guī)模納稅人按規(guī)定的納稅期限上繳稅款時(shí)，借記“應(yīng)交稅費(fèi)——應(yīng)交增值稅”科目，貸記“銀行存款”等科目。收到退回多繳的增值稅時(shí)，作相反的會計(jì)分錄。