有調(diào)查顯示，今年小企業(yè)主在享受結(jié)構(gòu)性減稅紅利的同時，相關(guān)行政性收費卻出現(xiàn)不小幅度的增長，一些中小企業(yè)整體稅費負擔甚至較以前更重，挫傷了他們的投資積極性。
近期財政收入同比增速出現(xiàn)下滑，但與財政收入下滑出現(xiàn)鮮明對比的是，地方的非稅收入出現(xiàn)暴增趨勢。前三季度，在全國稅收收入增幅比去年同期大幅回落18.8%的同時，地方非稅收入達10344億元，同比增長27.8%.
非稅收入的主要形式是“收費”，包括行政事業(yè)性收費、彩票公益金、國有資源有償使用收入、罰沒收入、捐贈收入、主管部門集中收入、財政資金產(chǎn)生的利息收入等。對于近期非稅收入的增長，財政部門認為，這主要是受地方探礦權(quán)、采礦權(quán)價款收入集中入庫以及加強國有資源（資產(chǎn)）有償使用收入等征管影響。
但分析人士稱，在一些地方公布的增長的非稅收入中，可以看出罰沒收入占了相當大的比重。以個別省份為例，前三季度稅收收入同比增幅僅為個位數(shù)，而罰沒收入同比增幅高達三成。
對此，一些中小企業(yè)人士認為，小型企業(yè)和微型企業(yè)整體稅負高于其他企業(yè)。
分析人士稱，非稅收入的逆勢增長一定程度上抵消了結(jié)構(gòu)性減稅為廣大中小企業(yè)帶來的福利。因此，取消不合理、不合法的涉企收費項目與落實好各項稅費減免政策一樣重要和迫切。盡管中小企業(yè)和大企業(yè)的適用稅率基本相同，但中小企業(yè)多處于競爭性領(lǐng)域，利潤較為微薄，中小企業(yè)對稅費負擔更為敏感。
分析人士建議，應繼續(xù)加大費改稅力度，通過深化財稅體制改革，初步建立起以稅收為主，少量的、必要的政府收費為輔的政府收入體系。進一步取消不合理的行政事業(yè)性收費項目，用減免登記費、注冊費等方式鼓勵創(chuàng)業(yè)，從嚴查處加重中小企業(yè)負擔和侵害中小企業(yè)權(quán)益的行為。
