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公司為員工代扣代繳的個稅現金流指定主要是通過設置代扣代繳系統(tǒng)，由制定公司內部稅務專員進行指定。具體步驟如下： 一、準備工作： 1.準備稅務指定函：由公司主管審核通過后，可打印準備好稅務指定函； 2.個人信息準備：公司為每一位員工準備完整的個人信息，包括姓名、身份證號、工號、社保編號等； 二、配置代扣代繳系統(tǒng)： 1.進入稅收系統(tǒng)：由專職稅務專員登錄財政部網站，進入稅收系統(tǒng)； 2.配置代扣代繳功能：根據公司準備的個人信息，配置代扣代繳功能； 3.完成指定：完成代扣代繳的指定，并保存指定函據備查。 總之，公司為員工代扣代繳的個稅現金流指定需要準備好個人信息，并通過財政部網站的稅收系統(tǒng)進行配置，最后完成指定并備案。 拓展知識：個人所得稅的指定，既可以由個人指定上繳所得稅，也可以由單位指定上繳所得稅。如果由單位指定上繳所得稅，單位需要與個人簽訂指定書，效力同個人指定上繳所得稅，單位可以直接向稅務機關申報并上繳個人所得稅。