稅收作為國家調(diào)控經(jīng)濟社會發(fā)展的重要工具，一直在實現(xiàn)經(jīng)濟結(jié)構(gòu)調(diào)整和經(jīng)濟發(fā)展方式轉(zhuǎn)變等方面具有獨特的作用。1994年稅制改革以來，我國相繼出臺并實施了一系列促進科技進步的稅收優(yōu)惠政策，對增加企業(yè)研發(fā)投入、發(fā)展高科技、實現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化、提升企業(yè)自主創(chuàng)新能力和核心競爭力，發(fā)揮了積極的推動作用?，F(xiàn)行稅制促進科技創(chuàng)新的激勵作用主要表現(xiàn)在以下兩個方面：一是通過稅收法律法規(guī)促進科技發(fā)展和自主創(chuàng)新，如對直接用于科學研究、科學試驗和教學的進口儀器設(shè)備免征增值稅，對農(nóng)業(yè)機耕及相關(guān)培訓免征營業(yè)稅，對提供專有技術(shù)取得的特許權(quán)使用費減免外資企業(yè)所得稅，對省（部）級以上單位頒發(fā)的科技獎金免征個人所得稅等。二是適時制定具體的稅收優(yōu)惠政策，對研究開發(fā)—科技成果轉(zhuǎn)化—成果產(chǎn)業(yè)化等不同環(huán)節(jié)、高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開發(fā)區(qū)等特定區(qū)域以及集成電路、軟件、科研機構(gòu)轉(zhuǎn)制、科學普及等實體或產(chǎn)品給予支持，以促進技術(shù)創(chuàng)新、發(fā)展高科技和推動科技體制改革。

　　據(jù)初步統(tǒng)計，現(xiàn)行稅制共對高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開發(fā)區(qū)、經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)等21類特殊區(qū)域?qū)嵭辛藚^(qū)別對待的稅收優(yōu)惠政策，以適應(yīng)改革開放和我國經(jīng)濟梯度開發(fā)與促進區(qū)域經(jīng)濟振興的需要，如：對包括中部6省的26個老工業(yè)基地城市的八大行業(yè)實行消費型增值稅改革試點、統(tǒng)一對研發(fā)費用所得稅前加計扣除、實行企業(yè)技改設(shè)備投資抵免新增所得稅、科技成果轉(zhuǎn)化免征相關(guān)稅收、內(nèi)外資項目投資總額內(nèi)進口設(shè)備免稅、進口科教用品免稅、高新區(qū)內(nèi)高新技術(shù)企業(yè)及軟件與集成電路產(chǎn)業(yè)實行減免稅、對科技創(chuàng)新與科學普及減免稅等。據(jù)不完全統(tǒng)計，2003年，僅對高新技術(shù)企業(yè)減免稅收就達250億元，2004年科技稅收減免合計達到700多億元?，F(xiàn)行涉稅法規(guī)及具體稅收政策有效地提高了企業(yè)科技創(chuàng)新的積極性和主動性，也充分發(fā)揮了高科技園區(qū)等特定區(qū)域的輻射和平臺作用。

　　現(xiàn)行政策仍存在問題

　　從現(xiàn)行稅制的運行實踐分析，現(xiàn)行促進科技進步的稅收政策也存在一些亟待解決的問題。

　　區(qū)域優(yōu)惠力度大、層次多，產(chǎn)業(yè)優(yōu)惠相對較弱且導向不夠清晰。目前，21個大類的區(qū)域稅收優(yōu)惠政策范圍廣、內(nèi)容豐富，雖然也體現(xiàn)對高科技產(chǎn)業(yè)的扶持，但產(chǎn)業(yè)稅收優(yōu)惠過于偏重對利潤的調(diào)節(jié)，特別是區(qū)域普惠稅收優(yōu)惠政策在一定程度上減弱了鼓勵高科技產(chǎn)業(yè)發(fā)展的導向功能。

　　稅收激勵政策較多偏重于創(chuàng)新結(jié)果而不是扶持創(chuàng)新過程，影響了稅收政策的效果。如：企業(yè)已被確認為高新技術(shù)企業(yè)或研發(fā)形成科技成果轉(zhuǎn)讓時，才能享受相關(guān)優(yōu)惠政策；加速折舊、投資抵免等扶持科技產(chǎn)業(yè)化的間接稅收優(yōu)惠政策受制于各種因素無法充分落實；因居民管轄權(quán)、稅收抵免等因素的制約，外商投資企業(yè)享受的稅收優(yōu)惠部分成為了發(fā)達國家的財政收入。

　　稅收扶持政策缺乏系統(tǒng)性，政策效應(yīng)有待進一步提高?，F(xiàn)行促進科技進步的稅收優(yōu)惠政策幾乎散見于現(xiàn)行稅制的各個稅種，但都具有特定的適用條件，如高新區(qū)內(nèi)高新技術(shù)企業(yè)與區(qū)外企業(yè)稅收待遇不一致，影響了企業(yè)的公平競爭。對科技企業(yè)采取增值稅、進口環(huán)節(jié)稅等優(yōu)惠政策，影響了增值稅制度的規(guī)范，也存在替代投資及財政支出等問題，越位嚴重。而對科技基礎(chǔ)研究、風險投資、產(chǎn)學研結(jié)合等的稅收優(yōu)惠政策支持力度不夠，存在一定的缺位現(xiàn)象。特別是部分稅收優(yōu)惠政策實施需要主管部門對優(yōu)惠主體進行認定與管理，存在一定的政策“博弈”現(xiàn)象。

　　稅收政策選擇

　　經(jīng)濟發(fā)展實踐表明，高科技成果的轉(zhuǎn)化與應(yīng)用、引進設(shè)備與技術(shù)、加大研發(fā)費用投入等是市場主體增強核心競爭力、追求高收益的成本，應(yīng)由市場機制發(fā)揮其基礎(chǔ)性的作用，政府不能替代企業(yè)進行市場決策。稅收扶持政策只是鼓勵企業(yè)發(fā)展高科技的“引子”，著重要為企業(yè)創(chuàng)造公平創(chuàng)新的稅收環(huán)境。

　　改革和完善主體稅種，增強增值稅和企業(yè)所得稅對發(fā)展高科技產(chǎn)業(yè)的適應(yīng)性。

　　積極推進增值稅轉(zhuǎn)型改革，允許企業(yè)抵扣外購機器設(shè)備等固定資產(chǎn)的進項稅額，不僅可以進一步消除重復征稅，鼓勵企業(yè)進行技術(shù)和設(shè)備投資，促進產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整和技術(shù)升級，提高產(chǎn)品的國際競爭力。也可以減輕企業(yè)稅收負擔，鼓勵企業(yè)增加科技創(chuàng)新的投資力度。當前應(yīng)認真總結(jié)增值稅轉(zhuǎn)型在東北地區(qū)與中部部分老工業(yè)基地城市試點的經(jīng)驗，密切關(guān)注宏觀經(jīng)濟的總體態(tài)勢，進一步完善全國統(tǒng)一實施的增值稅轉(zhuǎn)型改革方案，在條件成熟時，在全國范圍內(nèi)統(tǒng)一實施增值稅轉(zhuǎn)型改革。而新的企業(yè)所得稅法及擬議中的企業(yè)所得稅法實施條例將對現(xiàn)行企業(yè)所得稅稅前扣除政策予以規(guī)范，對高新技術(shù)企業(yè)實行15%的所得稅低稅率，以充分體現(xiàn)企業(yè)發(fā)展高科技對勞動力、資本和技術(shù)補償?shù)男枰?，在淡化區(qū)域所得稅優(yōu)惠政策的同時，強化以產(chǎn)業(yè)優(yōu)惠為主、輔以區(qū)域優(yōu)惠和兼顧社會發(fā)展的所得稅優(yōu)惠政策體制，促進高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展、鼓勵企業(yè)研發(fā)和增加資源能源節(jié)約利用。由于高科技園區(qū)主要集聚的是資金、技術(shù)密集型企業(yè)，因此，高科技產(chǎn)業(yè)將成為增值稅和企業(yè)所得稅改革的主要得益者。

　　規(guī)范稅收政策，促進科技創(chuàng)新和經(jīng)濟增長。

　　高科技產(chǎn)業(yè)發(fā)展、企業(yè)技術(shù)進步涉及的內(nèi)容十分廣泛，對企業(yè)技術(shù)開發(fā)費、設(shè)備更新、創(chuàng)業(yè)投資以及孵化器、大學科技園給予必要的稅收優(yōu)惠，有利于從根本上增強企業(yè)的自主創(chuàng)新和消化吸收能力，促進“高、精、尖”技術(shù)的應(yīng)用與產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)的升級、優(yōu)化。更好地體現(xiàn)稅收對高科技產(chǎn)業(yè)發(fā)展的引導作用。根據(jù)國務(wù)院關(guān)于《國家中長期科學和技術(shù)發(fā)展規(guī)劃綱要（2006-2010年）》以及國務(wù)院《關(guān)于印發(fā)實施<國家中長期科學和技術(shù)發(fā)展規(guī)劃綱要（2006-2010年）>若干配套政策的通知》的有關(guān)規(guī)定精神，財政部會同有關(guān)部門研究制定了促進高科技產(chǎn)業(yè)發(fā)展的具體稅收政策，促進了企業(yè)公平競爭和技術(shù)創(chuàng)新。

　　一是積極運用間接優(yōu)惠方式，推動企業(yè)科技進步。如：借鑒國際經(jīng)驗，采用加速折舊、投資抵免、虧損彌補、費用扣除等多種方式，將企業(yè)計稅工資稅前扣除限額統(tǒng)一提高到人均每月1600元；對企業(yè)當年的研發(fā)費用支出實行150%的所得稅前加計扣除，不足抵扣部分可在以后5年內(nèi)結(jié)轉(zhuǎn)抵扣；對企業(yè)當年提取并實際使用的職工教育經(jīng)費按計稅工資總額的2.5%實行企業(yè)所得稅稅前扣除；對企業(yè)用于研究開發(fā)的儀器和設(shè)備，單位價值在30萬元以下的，可一次或分次計入成本費用，單位價值超過30萬元的實行雙倍余額遞減法或年數(shù)總和法等加速折舊措施，進一步降低了企業(yè)科技創(chuàng)新的成本，有效地激勵了高科技企業(yè)進行的技術(shù)創(chuàng)新活動。

　　二是進一步完善了促進高新技術(shù)企業(yè)的稅收優(yōu)惠政策。自2006年1月1日起，國家對高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開發(fā)區(qū)內(nèi)新創(chuàng)辦的高新技術(shù)企業(yè)，自獲利年度起兩年內(nèi)免征企業(yè)所得稅，免稅期滿后減按15%的稅率征收企業(yè)所得稅。同時，將抓緊研究動漫產(chǎn)業(yè)、信息服務(wù)以及服務(wù)外包等促進現(xiàn)代服務(wù)業(yè)發(fā)展的有關(guān)稅收扶持措施。

　　三是運用稅收政策引導社會資金支持和發(fā)展高科技產(chǎn)業(yè)、企業(yè)和產(chǎn)品。稅收優(yōu)惠政策除了可以減少創(chuàng)新活動的成本，增加企業(yè)投資收益，從而增強企業(yè)投資創(chuàng)新活動的資金能力之外，還可以引導社會資金投資于中小型高新技術(shù)企業(yè)，緩解中小型科技企業(yè)融資難、創(chuàng)新難等問題?，F(xiàn)行稅收政策規(guī)定，對企事業(yè)單位通過公益性的社會團體和國家機關(guān)向科技型中小企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新基金的捐贈，企業(yè)在年度企業(yè)所得稅應(yīng)納稅所得額3％以內(nèi)的部分，個人在申報個人所得稅應(yīng)納稅所得額30％以內(nèi)的部分，準予在計算繳納所得稅稅前扣除；對創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)采取股權(quán)投資方式投資于未上市中小高新技術(shù)企業(yè)2年以上可按其對中小高新技術(shù)企業(yè)投資額的70%抵扣該創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)的應(yīng)納稅所得額。

　　四是完善稅收政策鼓勵科技成果的轉(zhuǎn)化。為進一步完善科技中介服務(wù)機構(gòu)的稅收優(yōu)惠政策，國家對符合條件的孵化器、大學科技園實行3年免征營業(yè)稅、房產(chǎn)稅和城鎮(zhèn)土地使用稅政策；對符合非營利組織條件的孵化器、大學科技園收入統(tǒng)一執(zhí)行新的企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策。