當前，一些行政事業(yè)單位無視國家稅法的規(guī)定，千方百計偷逃稅收。從近幾年對行政事業(yè)單位財政檢查情況看，其稅收流失的主要原因有：
納稅意識淡薄，認識不高。一些單位的領(lǐng)導(dǎo)和財務(wù)人員納稅觀念不強，認識模糊，普遍認為行政事業(yè)單位經(jīng)費來源主要是財政撥款，“吃財政飯的”，不需要納稅�！敖欢惥褪瞧髽I(yè)、個體私營業(yè)主的事，與行政事業(yè)單位無關(guān)”，納稅申報也就無從談起。此外，稅務(wù)部門在稅法宣傳和稅收征管方面，眼光僅局限于企業(yè)和個體私營業(yè)主的身上，忽視了行政事業(yè)單位，這也是造成行政事業(yè)納稅意識淡薄的一個重要原因。
票據(jù)管理混亂，監(jiān)控不嚴。目前，行政事業(yè)單位使用的票據(jù)種類較多。有行政事業(yè)性收費統(tǒng)一票據(jù)，也有非經(jīng)營性內(nèi)部往來收據(jù)，還有服務(wù)業(yè)等統(tǒng)一發(fā)票。有財政部門發(fā)放和管理的，也有稅務(wù)部門發(fā)放和管理的，還有單位從省、市以上部門或系統(tǒng)自行領(lǐng)取和經(jīng)批準自行印制的。由于財政、稅務(wù)部門在發(fā)票管理方面，各管各的，缺乏必要的溝通與協(xié)調(diào)統(tǒng)一，行政事業(yè)單位在票據(jù)使用的業(yè)務(wù)范圍上存在著“你中有我，我中有你”的交叉串戶現(xiàn)象。由于稅務(wù)部門對行政單位經(jīng)營項目收費使用票據(jù)監(jiān)控不嚴，以致應(yīng)稅收費項目的稅收大量流失。
報賬憑證不合法，假證假據(jù)悄然入賬。一是“白條”報賬。一些行政事業(yè)單位白條支付基本建設(shè)、維修工程款，數(shù)額巨大，況且業(yè)務(wù)發(fā)生比較頻繁，但沒有索取建筑安裝工程統(tǒng)一結(jié)算發(fā)票，沒有履行扣繳義務(wù)，讓應(yīng)代扣代繳建筑安裝等稅收付諸東流。二是利用非正式、過期或超范圍使用的發(fā)票報賬。支付業(yè)務(wù)招待費、工程結(jié)算款，以統(tǒng)一收款收據(jù)、商業(yè)零售統(tǒng)一發(fā)票或工業(yè)企業(yè)統(tǒng)一發(fā)票報銷，更有甚者以對方開具蓋有非財務(wù)結(jié)算公章的假發(fā)票、過期票據(jù)或正規(guī)的票據(jù)“小票大開”統(tǒng)統(tǒng)入賬，在無形中縱容了納稅人偷逃大量稅收。
化整為零，隱瞞應(yīng)稅收入，稅收白白流失。一是承租或承包經(jīng)營者偷逃房產(chǎn)稅、營業(yè)稅、城市維護建設(shè)稅。行政事業(yè)單位的房屋、門店、場地、食堂、招待所、文印室等對外出租或承包經(jīng)營不使用稅務(wù)發(fā)票來收取租金或經(jīng)營收入，或以勞務(wù)、非貨幣性實物等抵減租金或承包費，隱瞞了應(yīng)稅收入。而承包經(jīng)營或承租者，既沒辦理工商登記，又沒辦理稅務(wù)登記，加之依靠出租單位多方“配合”，借助其行政干預(yù)，不僅計稅困難，而且稅款征收阻力較大。二是個人所得稅零申報、未交或少扣現(xiàn)象普遍。大多數(shù)行政事業(yè)單位例行公事，僅對每月個人工資部分代扣代繳個人所得稅，而稿酬、實物、各種補助等工資外收入并未計入個人應(yīng)稅所得，有縱容個人偷稅逃稅的行為。
稅收管理存在盲區(qū)。從近幾年的財政檢查來看，行政事業(yè)單位將已使用過的固定資產(chǎn)出售變賣或抵償債務(wù)行為普遍存在偷逃稅現(xiàn)象，而稅務(wù)部門對此類業(yè)務(wù)留下了“空檔”、“死角”，很少觸及。如，有的單位出賣小汽車、摩托車等，未按變價收入依率征收增值稅，也未在此基礎(chǔ)上計征城市維護建設(shè)稅及附加。
