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單位可以僅使用電子會計憑證進行報銷入賬歸檔，但需要滿足一系列條件，包括接收的電子會計憑證必須合法、真實，電子會計憑證的傳輸、存儲必須安全、可靠，使用的會計核算系統(tǒng)能夠準確、完整、有效接收和讀取電子會計憑證及其元數(shù)據(jù)，并設(shè)定了必要的審簽程序。 對于與電子發(fā)票相關(guān)的記賬憑證、報銷憑證等，如果未實現(xiàn)電子化，單位應(yīng)單獨將電子發(fā)票通過歸檔接口或手工導(dǎo)入電子檔案管理系統(tǒng)進行整理、歸檔并長期保存。對于已實施會計信息系統(tǒng)的單位，與電子發(fā)票相關(guān)的記賬憑證、報銷憑證等如已全部實現(xiàn)電子化，可以將電子發(fā)票與相關(guān)的記賬憑證、報銷憑證等移交會計檔案管理人員保存。 電子發(fā)票的歸檔和管理還需要符合《會計檔案管理辦法》等相關(guān)要求。例如，電子發(fā)票的歸檔應(yīng)當真實、完整、可用和安全，便于檢索和查詢。歸檔的電子發(fā)票應(yīng)當保持原貌，并應(yīng)當具有防篡改功能。歸檔的電子發(fā)票應(yīng)當設(shè)置歸檔標識，歸檔后不得修改。同時，電子發(fā)票的保管應(yīng)當符合國家有關(guān)規(guī)定，可以通過設(shè)定查閱權(quán)限、進行加密處理等方式，確保電子發(fā)票不被篡改、損壞，防止電子發(fā)票丟失。