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對于注冊非獨立核算分公司，員工的工資是可以不由分公司發(fā)放的，但是，由于分公司是參保單位，因此必須通過分公司來實現(xiàn)社保繳費。而個稅僅僅和繳費有一定的關(guān)系，但是并不是一定要通過分公司來實現(xiàn)繳納，由主體公司一起繳納可能更加經(jīng)濟合理。 至于分公司是否可以單獨建賬，根據(jù)《企業(yè)會計準(zhǔn)則》第82條規(guī)定，經(jīng)營活動結(jié)果無法確定，或者存在主要屬性上的明顯差異，而存在實質(zhì)性經(jīng)濟關(guān)系，企業(yè)需要將其劃分為獨立核算項目。在不改變注冊分公司變更前提下，分公司可以自行建賬，但是具體說來，還是要對分公司的業(yè)務(wù)特點進行評估，根據(jù)實際情況來決定雙方的建賬方式。