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企業(yè)所得稅申報表和增值稅申報表金額存在差異時，需要進行研究，找出金額間的不一致點，才能確定如何處理。一般來說，原因可以分為三類：一類是因為稅收要素和計算方法的不同；第二類是因為稅收要素和計算方法有遺漏；第三類是因為存在稅收優(yōu)惠政策或其他特殊情況。 要處理企業(yè)所得稅與增值稅申報金額存在差異，首先需要根據(jù)稅收要素和計算方法做出相應(yīng)的調(diào)整，以便實現(xiàn)兩者的金額一致；其次，如果金額不一致，可將雙方均備有的憑證和報表結(jié)合起來審核，以便確定有效的稅收要素和稅收優(yōu)惠政策。最后，根據(jù)審計結(jié)果，采取相應(yīng)的調(diào)整或補繳政策來解決金額不一致問題。 拓展知識：在處理金額不一致問題時，還可以采取雙方同時對基本稅收要素作出更改或補充的方式，以期找到一個雙方滿意的處理方法，實現(xiàn)金額一致。