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答：發(fā)票應該開給總公司。根據(jù)《中華人民共和國發(fā)票管理條例》第十六條的規(guī)定，發(fā)票的開具方應當是實際發(fā)生經濟業(yè)務的主體，而不是業(yè)務支付發(fā)生者。在上述案例中，合同實質上是由總公司簽訂的，而分公司只是執(zhí)行付款，因此，發(fā)票應該由總公司開具。 另外，也可以考慮采用“三方開票”方式，也就是說，總公司作為開票方，由分公司支付，由購買方收取發(fā)票。此種方式可以滿足雙方的稅收訴求，降低交易風險，同時也可以提高賬款回收率，有利于雙方的商業(yè)發(fā)展。