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根據(jù)國家財政部相關(guān)規(guī)定，甲方支付工程款是以代發(fā)工資的名義支付給乙方的，乙方應(yīng)當繳納個人所得稅。當單筆應(yīng)發(fā)金額超過1,500元，以及月應(yīng)發(fā)金額超過4,500元時，納稅人應(yīng)當繳納稅款，稅率為個人所得稅的一般稅率，即20％。同時，除了個人所得稅外，還應(yīng)當繳納專項附加扣除，具體專項附加扣除項目可以根據(jù)乙方個人職業(yè)和地區(qū)等不同情況來確定。拓展知識：專項附加扣除是指增加扣除項目，以減免納稅人的稅負，具體包括子女教育、繼續(xù)教育、住房貸款利息、住房租金、大病醫(yī)療等。