案例：
2009年7月30日，稅務(wù)人員在對(duì)某高新技術(shù)企業(yè)2008年度的企業(yè)所得稅進(jìn)行檢查時(shí)發(fā)現(xiàn)，該企業(yè)2008年3月取得一筆由省科技廳無(wú)償撥付的科技補(bǔ)貼100萬(wàn)元。2008年6月，該企業(yè)利用其中的80萬(wàn)元購(gòu)買了一臺(tái)專門用于研發(fā)活動(dòng)的設(shè)備，并計(jì)入固定資產(chǎn)80萬(wàn)元，企業(yè)按10年的期限從2008年7月開(kāi)始計(jì)提折舊，當(dāng)年計(jì)提折舊4萬(wàn)元，此外有2萬(wàn)元用于在職直接從事研發(fā)活動(dòng)人員的工資支出，折舊4萬(wàn)元和工資2萬(wàn)元均在稅前扣除并同時(shí)加計(jì)扣除，加計(jì)扣除的研發(fā)支出符合《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈企業(yè)研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用稅前扣除管理辦法（試行）〉的通知》（國(guó)稅發(fā)[2008]116號(hào)）的規(guī)定。企業(yè)自行申報(bào)2008年度企業(yè)所得稅應(yīng)納稅所得額為2000萬(wàn)元，科技補(bǔ)貼100萬(wàn)元未從應(yīng)納稅所得額中扣減，企業(yè)無(wú)其它納稅調(diào)整事項(xiàng)。
由于《財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于專項(xiàng)用途財(cái)政性資金有關(guān)企業(yè)所得稅處理問(wèn)題的通知》（財(cái)稅[2009]87號(hào)）是2009年6月16日才發(fā)布的，而一般企業(yè)在5月31日前就已辦理年度匯算清繳，故當(dāng)時(shí)尚未執(zhí)行財(cái)稅[2009]87號(hào)文件。財(cái)稅[2009]87號(hào)規(guī)定，對(duì)企業(yè)在2008年1月1日至2010年12月31日期間從縣級(jí)以上各級(jí)人民政府財(cái)政部門及其他部門取得的應(yīng)計(jì)入收入總額的財(cái)政性資金，凡同時(shí)符合三個(gè)條件的，可以作為不征稅收入，在計(jì)算應(yīng)納稅所得額時(shí)從收入總額中減除。具體條件是：企業(yè)能夠提供資金撥付文件，且文件中規(guī)定該資金的專項(xiàng)用途；財(cái)政部門或其他撥付資金的政府部門對(duì)該資金有專門的資金管理辦法或具體管理要求；企業(yè)對(duì)該資金以及以該資金發(fā)生的支出單獨(dú)進(jìn)行核算。檢查人員經(jīng)認(rèn)真審查，確認(rèn)企業(yè)的科技補(bǔ)貼100萬(wàn)元符合財(cái)稅[2009]87號(hào)規(guī)定的不征稅條件。那么，該如何對(duì)企業(yè)2008年度應(yīng)納稅所得額進(jìn)行納稅調(diào)整呢？
納稅調(diào)整計(jì)算：按照財(cái)稅[2009]87號(hào)的規(guī)定，該企業(yè)取得的科技補(bǔ)貼100萬(wàn)元應(yīng)作為不征稅收入，同時(shí)不征稅收入用于支出所形成的費(fèi)用，不得在計(jì)算應(yīng)納稅所得額時(shí)扣除；用于支出所形成的資產(chǎn)，其計(jì)算的折舊、攤銷不得在計(jì)算應(yīng)納稅所得額時(shí)扣除。因此，該企業(yè)2008年度的折舊4萬(wàn)元和工資2萬(wàn)元及其相應(yīng)的加計(jì)扣除均不得在稅前扣除。
2008年度應(yīng)納稅所得額為2000-100+4+2+（4+2）×50%＝1909（萬(wàn)元）
應(yīng)納企業(yè)所得稅1909×15%＝286.35（萬(wàn)元）
比原先申報(bào)稅款少了2000×15%-286.35＝13.65（萬(wàn)元）
應(yīng)按規(guī)定進(jìn)行退抵手續(xù)。
分析：
財(cái)政性資金，到底是“免稅收入”還是“不征稅收入”要嚴(yán)格區(qū)分，按照企業(yè)所得稅法實(shí)施條例的規(guī)定，企業(yè)的不征稅收入用于支出所形成的費(fèi)用或者財(cái)產(chǎn)，不得扣除或者計(jì)算對(duì)應(yīng)的折舊、攤銷扣除，而免稅收入用于支出所形成的費(fèi)用或者財(cái)產(chǎn)，則可以扣除或者計(jì)算對(duì)應(yīng)的折舊、攤銷扣除。稅務(wù)人員在對(duì)企業(yè)進(jìn)行檢查時(shí)，如果是執(zhí)行《小企業(yè)會(huì)計(jì)制度》的企業(yè)，要注意其“營(yíng)業(yè)外收入”等科目，如果是執(zhí)行《企業(yè)會(huì)計(jì)制度》的企業(yè)，要注意“補(bǔ)貼收入”等科目，如果是執(zhí)行新《企業(yè)會(huì)計(jì)準(zhǔn)則》的企業(yè)，則要注意“遞延收益”和“營(yíng)業(yè)外收入”等科目，此外還要注意企業(yè)的“其它應(yīng)付款”、“專項(xiàng)應(yīng)付款”等相關(guān)科目，弄清財(cái)政性資金的來(lái)源及去向，嚴(yán)格區(qū)分“免稅收入”和“不征稅收入”的稅務(wù)處理，既要充分保護(hù)納稅人享受好稅收優(yōu)惠，同時(shí)也不能讓國(guó)家稅收受損失。